Κύριες ταξινομήσεις αντιβιοτικών

Σύμφωνα με τη χημική τους δομή, τα αντιβιοτικά μπορούν να χωριστούν σε αντιβιοτικά κινολόνης, - αντιβιοτικά λακτάμης, μακρολίδες, αμινογλυκοσιδικά αντιβιοτικά κ.λπ.
Ανάλογα με τις χρήσεις τους, τα αντιβιοτικά μπορούν να χωριστούν σε αντιβακτηριακά αντιβιοτικά, αντιμυκητιακά αντιβιοτικά, αντικαρκινικά αντιβιοτικά, αντιιικά αντιβιοτικά, αντιβιοτικά ζώων, γεωργικά αντιβιοτικά και άλλα μικροβιακά φάρμακα (όπως τα αλκαλοειδή της ερυσιβώδους ερυσιβώδους που παράγονται από βακτήρια ερυσιβώδους μορφής που έχουν φαρμακολογική δράση και έχουν αποτέλεσμα της συστολής της μήτρας).
Ανάλογα με τους διαφορετικούς τύπους τους, τα αντιβιοτικά μπορούν να παραχθούν με διάφορους τρόπους, όπως η πενικιλίνη που βιοσυντίθεται με μικροβιακή ζύμωση, σουλφοναμίδια, κινολόνες κ.λπ., που μπορούν να παραχθούν με μεθόδους χημικής σύνθεσης. Υπάρχουν επίσης ημισυνθετικά αντιβιοτικά, τα οποία είναι διάφορα παράγωγα που παράγονται με την τροποποίηση της μοριακής δομής των αντιβιοτικών που παράγονται με βιοσύνθεση χρησιμοποιώντας χημικές, βιολογικές ή βιοχημικές μεθόδους.